Котешките тоалетни обикновено трябва да се почистват на всеки две до три седмици. Точната честота на почистване зависи от индивидуалните модели на елиминиране на всяка котка. Ако една котка произвежда голямо количество отпадъци, интервалът на почистване може да бъде съответно съкратен и обратно. Ако кутията за отпадъци не се почиства за продължителен период от време, урината на котката не може да се абсорбира, което води до силна миризма и растеж на бактерии.

